两日后，南京。
孙传庭带着几个得力的属官，进了南京，就被崇祯爷召见皇宫去了。
崇祯此时心情十分痛快，主动把南京皇宫让出来一半，作为新成立总理通商衙门的治所。孙传庭推拒不得，再说原来的衙门本来地方就小，施展不开，他只得笑纳了皇上的好意，把衙门搬进皇宫了。
南京皇宫一分为二，中间隔了一道围墙，分出来的几百间房舍，大殿，就成了总理衙门的新治所。这位崇祯陛下总算干了件好事，此后时代变迁，几次修缮，总理通商衙门的地点却始终没变。
孙传庭到了南京，有了治所，手下又有两千多名军情司老卒助阵，便打起精神，开始大展拳脚。他四十许人，正值壮年，精力可比方从哲旺盛多了，下面的属官，地方官员想蒙蔽他，难上加难。
这位孙大人睁开慧眼，和人在辽东的摄政王马城书信，公函往来。他是个极聪颖的人，心里明镜一般透亮，知道王爷拿出这三千多个实缺，这是要给大家伙分饼了。他是个心高气傲的人，平日里谦谦君子一般，十分低调，骨子里却是自视甚高的，却独独对当年摄政王马
城，心服口服。
王爷主政大明这两年，都干了些什么，可说是按部就班，有条不紊。
王爷先稳定了军心，民心，先革新军制，五十万常备新军，各就各位，仅南京各省标营新军，人数就多达十万之众。十万装备精良的新军，经过半年多的整训，士气正是最高昂的时候。
十万新军，虎视眈眈的弹压地方，试问谁还敢上蹿下跳的蹦跶。
扬州之乱闹的沸沸扬扬，新军一进城还不是烟消云散了，一排黑洞洞火铳打过去，任你是江湖上的好汉，市井街头上的泼皮无赖，还是身家显赫的大豪商，身上都得多几个窟窿，往外喷血。
王爷鼎力支持，新军得力，孙传庭便有恃无恐，开始施展他的拳脚。这第一条，先清算旧账，新成立的警察司，带着新军士兵分赴各地，开始抓人，凡参与叛乱的通通抓起来，押解到南京。或斩立决，或发配流放，绝不含糊，江南之地，这块大明帝国心尖子上的恶疾，再
次被惨烈的清洗了。江南，始终是大明帝国的一块心病，这也怨不得别人。钱能通神，有钱能使鬼推磨，有钱带来了科举的发达，加之一千年来，学而优者仕的传统，江南的繁华锦绣之下，不免藏污纳垢，见不得人的斑斑劣
迹，太多了。
孙传庭心里明白，王爷，是真的不耐烦了，下决心去掉这块心病了。王爷不耐烦了，后果很可怕，杀气腾腾的新军士兵，在两千多名军情司老卒的率领下，凶神恶煞般踹开大门，轰开一个个据点，庄子。江南再次被清洗了，这回清洗的力度之大，连地方三法司也噤若寒蝉
，不敢吭声，免的犯了王爷的忌讳，触了这些官兵的霉头。那官兵一队队的虎背熊腰，手中火铳
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